Posted 12 июля, 08:06
Published 12 июля, 08:06
Modified 12 июля, 08:09
Updated 12 июля, 08:09
Научную работу вчера опубликовали в журнале Cell. Потрясающе детализированная структура сохранилась случайно: когда этот мамонт умер, его ДНК быстро замерзла, высохла и осталась в состоянии, похожем на стекло.
Как правило, древние образцы ДНК состоят из очень маленьких, разрозненных фрагментов. Опираясь на работы по созданию трехмерной структуры генома человека, ученые решили, что подходящий образец древней ДНК можно использовать, чтобы теми же методами собрать древний геном.
Исследователи 5 лет проверяли множество образцов, пока не остановились на шерстистом мамонте, которого раскопали в Сибири в 2018 году. Чтобы воссоздать архитектуру его генома, исследователи применили модернизированный метод Hi-C, который назвали PaleoHi-C. Он позволяет определить, какие участки ДНК могли быть рядом друг с другом и взаимодействовать в ядре.
Ученые сравнивают работу по сборке генома со сборкой пазла из трех миллиардов кусочков без изображения, которое должно получиться в конце. PaleoHi-C дал им хотя бы общее представление.
Затем исследователи объединили эти сведения с секвенированием ДНК, что позволило создать упорядоченную карту генома. Как образец использовали геном слонов.
Выяснилось, что у мамонтов, как и у нынешних слонов, было 28 хромосом. При этом клетки кожи отличаются характером активации генов, в том числе тех, что связаны с шерстяным покровом и устойчивостью к холоду. Это первое измерение клеточной активности генов в древнем образце ДНК.
Хотя ученые и использовали окаменелость, которая сохранилась необычайно хорошо, они с оптимизмом ожидают, что метод можно будет использовать и для анализа ДНК других древних образцов, например, египетских мумий.